Mathematica メニューコマンド「ファイル(File)」→「特別な形式で保存(Save as Special)」→「パッケージ形式(Package Format)」
この方法ではノートブックはパッケージとして保存されます.初期化セルである入力セルはすべてパッケージに含まれます.他のセルはコメントとして保存されます.以下のメニューコマンドで初期化セルプロパティを設定することができます.
「セル(Cell)」→「セルのプロパティ(Cell Properties)」→「初期化セル(Initialization Cell)」
オプションインスペクタ(「書式(Format)」→「オプションインスペクタ(Option Inspector)」)を用いることもできます.オプションインスペクタの詳細については以下のFAQをご参照ください.
http://support.wolfram.co.jp/mathematica/interface/options/inspector.html
次のメニューコマンドを選ぶと,オプションインスペクタのオプションが設定できます.
「セル設定」→「評価設定」→「InitializationCell(初期化セル)」→「True」