Wolfram Computation Meets Knowledge

macOSマシンおよびLinuxマシンでリモートカーネルを使う方法

背景情報

Mathematicaにおける並列化では,制御カーネルがいくつかの従属カーネル(サブカーネル)を管理するハブアンドスポークモデルが使われています.このため,ローカルのサブカーネルに加えて,Mathematicaがインストールされているリモートコンピュータが追加のサブカーネルを提供することもできます.

サブカーネルを提供するリモートコンピュータはホスト,制御カーネルを実行するコンピュータはクライアントと呼ばれます.ホストコンピュータがLinuxまたはmacOSオペレーティングシステムを実行している場合,MathematicaはSSHを使ってリモートのWolframカーネルに接続することができます.

設定

  1. ホストコンピュータとクライアントコンピュータの間にパスワードのない秘密鍵/公開鍵のペアを設定します.設定について不明点がある場合は,ご所属機関のシステム管理者にお問い合せ ください.
  2. クライアントコンピュータ上でMathematicaを起動し,新規のノートブックを開きます.
  3. そのノートブックの中で,KernelConfigurationを使ってリモートマシン上のSSHカーネルを指定します.

    kernel = KernelConfiguration["ssh://remote-host-name", "KernelCommand" -> "full path to kernel"]

    例えば,MathematicaをデフォルトインストールしたmacOSのリモートマシンでは,以下のようにSSHカーネルを指定します.

    In[1]:= kernelConfigMacOS = KernelConfiguration["ssh://myRemoteMac",
    "KernelCommand" -> "/Applications/Mathematica.app/Contents/MacOS/WolframKernel"]

    MathematicaをデフォルトインストールしたLinuxのリモートマシンでは,以下のように指定します.

    In[1]:= kernelConfigLinux = KernelConfiguration["ssh://myRemoteLinux",
    "KernelCommand" -> "/usr/local/Wolfram/Mathematica/13.1/SystemFiles/Kernel/Binaries/Linux-x86-64/WolframKernel"]

  4. LaunchKernels[]を使ってリモートカーネルを起動し,任意の並列計算機能を使って並列計算を実行します.

    例えば,macOSのリモートマシン上で起動した4個のカーネルを使って並列計算を行います.

    In[2]:= kernelsOnMacOS = LaunchKernels[kernelConfigMacOS, 4];
    
    ParallelEvaluate[{$KernelID,$MachineName,$Version}, kernelsOnMacOS]
    
    Out[3]= {{9, myRemoteMac, 13.1.0 for Mac OS X ARM (64-bit) (June 16, 2022)},
    {10, myRemoteMac, 13.1.0 for Mac OS X ARM (64-bit) (June 16, 2022)},
    {11, myRemoteMac, 13.1.0 for Mac OS X ARM (64-bit) (June 16, 2022)},
    {12, myRemoteMac, 13.1.0 for Mac OS X ARM (64-bit) (June 16, 2022)}}

    Linuxのリモートマシン上で起動した4個のカーネルを使って並列計算を行います.

    In[2]:= kernelsOnLinux = LaunchKernels[kernelConfigLinux, 4];
    
    ParallelEvaluate[{$KernelID,$MachineName,$Version}, kernelsOnLinux]
    
    Out[3]= {{17, myRemoteLinux, 13.1.0 for Linux x86 (64-bit) (June 16, 2022)},
    {18, myRemoteLinux, 13.1.0 for Linux x86 (64-bit) (June 16, 2022)},
    {19, myRemoteLinux, 13.1.0 for Linux x86 (64-bit) (June 16, 2022)},
    {20, myRemoteLinux, 13.1.0 for Linux x86 (64-bit) (June 16, 2022)}}

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